Работа в ГОУ ВО «Коми республиканская академия государственной службы и управления» (КРАГСиУ)

2003-2013 лаборант кафедры экономики и информационных процессов управления, преподаватель, ведущий специалист, начальник центра качества, первый проректор, доцент кафедры.

Работа в ФГБОУ ВО «Сыктывкарский государственный университет имени Питирима Сорокина»

2013-2015 – проректор по программам развития и инновационной деятельности.

2015-2016 – первый проректор.

2016-2017 – исполняющий обязанности ректора университета.

2019-2022 – профессор университета.

В эти годы Н.А. Михальченкова руководила процессами стратегического развития, инноваций и управления качеством образования, разработкой программы развития и кампусной информационной системы вуза, открывала новые направления подготовки для арктического макрорегиона,  а также возглавляла университет в переходный период, обеспечивая его устойчивое функционирование и взаимодействие с региональными и федеральными структурами.